Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms