Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RIGQ13278 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RIGQ13278 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RIGQ13278 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RIGQ13278 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RIGQ13278 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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