Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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