Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX3Q13185 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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