Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ANK3Q12955 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms