Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIAQ12857 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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