Protein–RNA interactions for Protein: Q07157

TJP1, Tight junction protein ZO-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TJP1Q07157 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TJP1Q07157 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TJP1Q07157 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TJP1Q07157 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TJP1Q07157 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms