Protein–RNA interactions for Protein: P82251

SLC7A9, b(0,+)-type amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A9P82251 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC7A9P82251 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms