Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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