Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms