Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDH1P40925 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDH1P40925 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MDH1P40925 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MDH1P40925 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MDH1P40925 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MDH1P40925 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms