Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGFBR1P36897 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms