Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCKARP32238 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCKARP32238 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKARP32238 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms