Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD53P19397 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD53P19397 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms