Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIMD1P0DJR0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIMD1P0DJR0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIMD1P0DJR0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIMD1P0DJR0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIMD1P0DJR0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIMD1P0DJR0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIMD1P0DJR0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GIMD1P0DJR0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIMD1P0DJR0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIMD1P0DJR0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIMD1P0DJR0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms