Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC4A1P02730 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms