Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHDP01880 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHDP01880 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHDP01880 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHDP01880 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHDP01880 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHDP01880 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHDP01880 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHDP01880 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHDP01880 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms