Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASA4O43374 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RASA4O43374 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RASA4O43374 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RASA4O43374 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RASA4O43374 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms