Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms