Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms