Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCE3A1L190 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCE3A1L190 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCE3A1L190 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCE3A1L190 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCE3A1L190 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCE3A1L190 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCE3A1L190 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCE3A1L190 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCE3A1L190 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCE3A1L190 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SYCE3A1L190 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCE3A1L190 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms