Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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