Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms