Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms