Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HCN3Q9P1Z3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HCN3Q9P1Z3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms