Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms