Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FANCFQ9NPI8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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