Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms