Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms