Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms