Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZNF354BQ96LW1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNF354BQ96LW1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms