Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3AQ92664 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms