Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CIPC-207ENST00000556863 538 ntTSL 314.11□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 BRF1-222ENST00000635152 2876 ntTSL 214.09□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CYTH4-211ENST00000480510 815 ntTSL 214.09□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 KIF3C-203ENST00000417737 5452 ntTSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 MYLK-AS1-201ENST00000463408 568 ntTSL 414.07□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CDIP1-203ENST00000562579 577 ntTSL 514.07□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 MRPS11-203ENST00000557974 504 ntTSL 414.06□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ING5-209ENST00000489509 920 ntTSL 214.05□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 514.04□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SNX6-205ENST00000555648 467 ntTSL 314.02□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ATP5A1-211ENST00000590156 1931 ntTSL 214.01□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.171e-12■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 GIT1-213ENST00000583413 546 ntTSL 414□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 F13A1-202ENST00000414279 582 ntTSL 413.99□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TLE2-212ENST00000589205 574 ntTSL 313.99□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CAPN15-206ENST00000568402 540 ntTSL 413.97□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 RIPOR1-216ENST00000566815 929 ntTSL 513.97□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 RIPOR1-206ENST00000561534 714 ntTSL 513.97□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ENO2-207ENST00000537688 547 ntTSL 513.96□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 DEAF1-203ENST00000525626 585 ntTSL 313.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SNX6-206ENST00000556162 1855 ntTSL 213.91□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC13.9□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 BRF1-210ENST00000547374 3809 ntTSL 513.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SH3BP5-209ENST00000465894 532 ntTSL 513.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 GPATCH2L-212ENST00000557263 1458 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 HDAC7-216ENST00000450805 579 ntTSL 413.83□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ATP5A1-217ENST00000591981 565 ntTSL 413.82□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 GPX4-203ENST00000585480 501 ntTSL 213.82□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 POLA2-208ENST00000534785 741 ntTSL 313.81□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 IRAK4-206ENST00000547521 1757 ntTSL 213.8□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 213.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 AMPD3-218ENST00000534047 2376 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CACNA1D-213ENST00000636595 1600 ntTSL 513.72□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 RBM4-208ENST00000510173 782 ntTSL 313.7□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 RARA-205ENST00000420042 1052 ntTSL 313.68□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 LMF1-214ENST00000569516 3358 ntTSL 213.68□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SUN1-217ENST00000450538 570 ntTSL 413.67□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TSG101-209ENST00000544804 391 ntTSL 313.66□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PLIN3-203ENST00000587462 604 ntTSL 413.62□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 NDUFV1-224ENST00000532343 620 ntTSL 313.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 NDUFV1-215ENST00000529867 582 ntTSL 313.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CHST12-203ENST00000432336 921 ntTSL 213.57□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SNHG14-218ENST00000553108 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PTBP1-216ENST00000590887 642 ntTSL 313.54□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SEC14L1-203ENST00000431431 2504 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 KANSL1-229ENST00000639531 2731 ntTSL 513.54□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 NACC2-203ENST00000467669 452 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SLC25A29-220ENST00000557438 534 ntTSL 313.51□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 50.8
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