Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC12Q8WUD4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms