Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms