Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL40Q2TBA0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms