Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCOLCEQ15113 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms