Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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