Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BNIP1Q12981 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms