Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms