Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD83Q01151 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD83Q01151 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD83Q01151 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD83Q01151 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD83Q01151 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD83Q01151 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD83Q01151 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD83Q01151 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD83Q01151 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD83Q01151 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD83Q01151 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD83Q01151 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD83Q01151 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD83Q01151 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD83Q01151 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD83Q01151 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD83Q01151 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD83Q01151 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD83Q01151 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms