Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms