Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BACE1P56817 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BACE1P56817 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BACE1P56817 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BACE1P56817 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms