Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AFMP43652 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AFMP43652 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AFMP43652 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AFMP43652 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AFMP43652 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AFMP43652 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AFMP43652 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AFMP43652 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AFMP43652 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AFMP43652 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AFMP43652 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AFMP43652 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms