Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.192e-11■■■□□ 17.4
GTF2F1P35269 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.982e-11■■■□□ 17.4
GTF2F1P35269 CAPNS1-214ENST00000592483 431 ntTSL 526.44■■□□□ 1.822e-11■■■□□ 17.4
GTF2F1P35269 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.782e-11■■■□□ 17.4
GTF2F1P35269 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.652e-11■■■□□ 17.4
GTF2F1P35269 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.52e-11■■■□□ 17.4
GTF2F1P35269 CAPNS1-212ENST00000591041 812 ntTSL 324.07■■□□□ 1.442e-11■■■□□ 17.4
GTF2F1P35269 CTDSP1-209ENST00000488627 1118 ntTSL 317.58■□□□□ 0.42e-11■■■□□ 17.4
GTF2F1P35269 CTDSP1-208ENST00000482272 984 ntTSL 215.09■□□□□ 0.012e-11■■■□□ 17.4
GTF2F1P35269 CTDSP1-206ENST00000464255 926 ntTSL 514.68□□□□□ -0.062e-11■■■□□ 17.4
GTF2F1P35269 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.295e-15■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.585e-15■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 224.7■■□□□ 1.542e-10■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.371e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 512.81□□□□□ -0.361e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.369e-7■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 EPS8L2-220ENST00000531393 2304 ntTSL 1 (best)23.2■■□□□ 1.39e-7■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 EPS8L2-211ENST00000527832 1597 ntTSL 222.85■■□□□ 1.259e-7■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.029e-7■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 ZNF598-206ENST00000564824 2147 ntTSL 528.31■■■□□ 2.123e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.873e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 ZNF598-207ENST00000565396 4457 ntTSL 222.72■■□□□ 1.233e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 ZNF598-203ENST00000562988 3382 ntTSL 522.54■■□□□ 1.23e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.143e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 230.19■■■□□ 2.422e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 330.19■■■□□ 2.422e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 523.94■■□□□ 1.422e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.581e-9■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 HOXB3-213ENST00000552000 466 ntTSL 36.33□□□□□ -1.41e-9■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.762e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.542e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 SSX2IP-207ENST00000481102 2457 ntTSL 522.86■■□□□ 1.252e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 SSX2IP-202ENST00000422026 759 ntTSL 315.02■□□□□ -02e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 SSX2IP-206ENST00000476905 2272 ntTSL 29.93□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.194e-7■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 SEMA4C-206ENST00000482925 3776 ntTSL 215.95■□□□□ 0.149e-9■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 227.52■■■□□ 22e-7■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PIGS-213ENST00000583631 546 ntTSL 525.07■■□□□ 1.63e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PIGS-212ENST00000582721 594 ntTSL 421.83■■□□□ 1.093e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PIGS-215ENST00000584413 577 ntTSL 417.98■□□□□ 0.473e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PIGS-208ENST00000577594 481 ntTSL 216.21■□□□□ 0.193e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.033e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PIGS-214ENST00000584080 584 ntTSL 414.75□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 213.57□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-6■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 DNAJB6-210ENST00000453383 590 ntTSL 413.39□□□□□ -0.273e-12■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 DNAJB6-202ENST00000412557 506 ntTSL 312.94□□□□□ -0.343e-12■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 ARF3-204ENST00000485410 563 ntTSL 321.45■■□□□ 1.022e-14■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-14■■■□□ 17.3
GTF2F1P35269 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.471e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.831e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 SSBP4-208ENST00000600628 550 ntTSL 39.65□□□□□ -0.862e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 MGAT5-203ENST00000468758 816 ntTSL 527.14■■□□□ 1.943e-7■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 MGAT5-204ENST00000481801 651 ntTSL 327.14■■□□□ 1.943e-7■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.871e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CHTF18-216ENST00000565787 607 ntTSL 526.17■■□□□ 1.789e-10■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)24.75■■□□□ 1.559e-10■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.362e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 GYG2-208ENST00000520904 624 ntTSL 322.89■■□□□ 1.251e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 BRD2-217ENST00000584808 547 ntTSL 422.61■■□□□ 1.212e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 BRD2-216ENST00000581002 550 ntTSL 422.61■■□□□ 1.212e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CHTF18-218ENST00000569270 711 ntTSL 521.8■■□□□ 1.089e-10■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PPP2R5E-203ENST00000553266 1690 ntTSL 1 (best)20.35■□□□□ 0.852e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 BRD2-215ENST00000580234 718 ntTSL 420.06■□□□□ 0.82e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.742e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.322e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PHF3-204ENST00000481385 2787 ntTSL 216.21■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 MEMO1-209ENST00000490459 1242 ntTSL 216.15■□□□□ 0.182e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 MEMO1-208ENST00000437854 315 ntTSL 515.96■□□□□ 0.152e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PHF3-212ENST00000515594 3074 ntTSL 215.26■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PHF3-205ENST00000494284 2854 ntTSL 214.24□□□□□ -0.132e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 GYG2-203ENST00000381161 2852 ntTSL 214.03□□□□□ -0.161e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.32e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CAP2-201ENST00000229922 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CAP2-204ENST00000476263 891 ntTSL 512.76□□□□□ -0.372e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PHF3-208ENST00000506783 3700 ntTSL 1 (best)11.1□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CAP2-205ENST00000479291 1378 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.672e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PPP2R5E-206ENST00000556484 1465 ntTSL 210.67□□□□□ -0.72e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.832e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 CAP2-203ENST00000465994 1404 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.882e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PPP2R5E-205ENST00000556150 744 ntTSL 36.45□□□□□ -1.382e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.442e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 DPY30-206ENST00000446765 1519 ntTSL 55.77□□□□□ -1.492e-8■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PHF3-210ENST00000509876 7124 ntTSL 1 (best)5.22□□□□□ -1.572e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.772e-6■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 ABHD17A-203ENST00000588598 5425 ntTSL 222.75■■□□□ 1.238e-10■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 ABHD17A-206ENST00000592757 740 ntTSL 322.01■■□□□ 1.118e-10■■■□□ 17.2
GTF2F1P35269 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.868e-10■■■□□ 17.2
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 281.3 ms