Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX2P28328 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms