Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms