Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TK1P04183 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TK1P04183 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TK1P04183 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TK1P04183 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms