Protein–RNA interactions for Protein: P01036

CST4, Cystatin-S, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST4P01036 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST4P01036 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CST4P01036 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CST4P01036 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CST4P01036 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CST4P01036 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CST4P01036 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CST4P01036 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CST4P01036 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CST4P01036 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CST4P01036 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CST4P01036 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms