Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG13O75143 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG13O75143 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms